「3D必須化」の状況に関係なく
 設定項目「3Dセキュア利用」が「3DS2.0を利用」であれば、利用可能です。

設定項目の確認方法：3Dセキュア2.0／今すぐ使えるかどうかを調べる方法

 「3D必須化」項目は、すべての決済で3Dセキュア認証を必須にするかどうかを設定するものです。 
詳細は 3Dセキュア2.0 / 3DS必須化〈利用する〉〈利用しない〉の違いを知りたい を参照ください。